La metodología central de la RAPCA es el Pastoreo Controlado, definido como la labor realizada por el ganado que, con una intervención reiterada a lo largo del año y bajo la vigilancia del pastor, logra la reducción del pasto y el matorral en las infraestructuras contraincendios.

El proceso comienza con la selección de zonas en coordinación con el Centro Operativo Provincial (COP) del Plan INFOCA, priorizando áreas con alta tradición ganadera, donde el mantenimiento de cortafuegos resulta costoso por dificultad (lejanía o pedregosidad), y que cuenten con infraestructuras ganaderas básicas (apriscos o puntos de agua). 

A continuación, se procede a la contratación de pastores. Los pastores guían activamente a su ganado menor (ovejas y cabras) en las zonas demarcadas, ya que se optó expresamente por el pastoreo guiado por personas pastoras vocacionales frente a los vallados, valorando su compromiso con la labor preventiva. La relación con las personas ganaderas se formaliza mediante contratos anuales o concesiones/autorizaciones de aprovechamientos de pastos.

La RAPCA formalizó un procedimiento de compensación económica para las personas pastoras cuya actuación se ajustará al compromiso acordado, entendiendo que es un pago por un servicio que prestan a la sociedad y no una subvención a priori. La cantidad máxima a pagar se calcula en función de la superficie asignada y las dificultades inherentes al área (relieve, distancia del aprisco y la intensidad de rebrote de la vegetación). En Jaén, por ejemplo, se conceden lotes de pastos-cortafuegos con valores de liquidación post-RAPCA que oscilan entre 884,16 € y 26.726,51 € (datos de 2022).

El oficio de pastor está en declive, y el reemplazo generacional es bajo, ya que no se percibe como una profesión atractiva.

Es habitual que los pastores optimicen su gestión ganadera y pastoreen de forma irregular u ocasional en las áreas cortafuegos, limitando la eficacia del control vegetal.

Al inicio, el sistema era novedoso en Andalucía y había pocas experiencias locales, basándose en el referente francés. Históricamente, también ha existido un "desencuentro" entre gestores forestales y ganaderos.

La innovación reside en la integración de I+D en la gestión directa, con el apoyo científico constante del CSIC y la colaboración interdisciplinar. Además, el sistema de pago basado en la evaluación del trabajo es un incentivo clave para asegurar la efectividad del servicio. La RAPCA ha demostrado ser un sistema con bajo impacto ambiental y que resulta más barato que otros medios de prevención (como los químicos o mecánicos).